Veřejná výzkumná instituce (zkratka za názvem v. v. i.) je veřejnou výzkumnou institucí, právnickou osobou, jejímž hlavním předmětem činnosti je výzkum, včetně zajišťování infrastruktury výzkumu, vymezený zákonem č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu, experimentálního vývoje a inovací z veřejných prostředků.

Veřejná výzkumná instituce svou hlavní činností zajišťuje výzkum podporovaný zejména z veřejných prostředků v souladu s podmínkami pro poskytování veřejné podpory stanovenými právem Evropských společenství.

Veřejná výzkumná instituce může být zřízena Českou republikou nebo územním samosprávným celkem; jménem České republiky plní funkci zřizovatele veřejné výzkumné instituce ministerstvo, jiný ústřední orgán státní správy nebo Akademie věd České republiky v postavení organizačních složek České republiky.

Činnost veřejné výzkumné instituce musí být v souladu se zvláštními právními předpisy upravujícími veřejnou podporu. Informace o výsledcích výzkumné činnosti veřejné výzkumné instituce musí být veřejně dostupné v informačním systému výzkumu a vývoje a ve výroční zprávě o činnosti a hospodaření veřejné výzkumné instituce.

Instituce Akademie věd ČR

Akademie věd České republiky (AV ČR) zahrnuje přes 50 vědeckých ústavů rozdělených do tří oblastí a celkem devíti sekcí:

Oblast věd o neživé přírodě

Sekce matematiky, fyziky a informatiky

• Astronomický ústav AV ČR
• Fyzikální ústav AV ČR
• Matematický ústav AV ČR
• Ústav informatiky AV ČR
• Ústav jaderné fyziky AV ČR
• Ústav teorie informace a automatizace AV ČR

Sekce aplikované fyziky

• Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR
• Ústav fyziky materiálů AV ČR
• Ústav fyziky plazmatu AV ČR
• Ústav pro hydrodynamiku AV ČR
• Ústav přístrojové techniky AV ČR
• Ústav teoretické a aplikované mechaniky AV ČR
• Ústav termomechaniky AV ČR

Sekce věd o Zemi

• Geofyzikální ústav AV ČR
• Geologický ústav AV ČR
• Ústav fyziky atmosféry AV ČR
• Ústav geoniky AV ČR
• Ústav struktury a mechaniky hornin AV ČR

Oblast věd o živé přírodě a chemických věd

Sekce chemických věd

• Ústav analytické chemie AV ČR
• Ústav anorganické chemie AV ČR
• Ústav chemických procesů AV ČR
• Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR
• Ústav makromolekulární chemie AV ČR
• Ústav organické chemie a biochemie AV ČR

Sekce biologických a lékařských věd

• Biofyzikální ústav AV ČR
• Biotechnologický ústav AV ČR
• Fyziologický ústav AV ČR
• Mikrobiologický ústav AV ČR
• Ústav experimentální botaniky AV ČR
• Ústav experimentální medicíny AV ČR
• Ústav molekulární genetiky AV ČR
• Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR

Sekce biologicko-ekologických věd

• Biologické centrum AV ČR
• Botanický ústav AV ČR
• Ústav biologie obratlovců AV ČR
• Ústav výzkumu globální změny AV ČR

Oblast humanitních a společenských věd

Sekce sociálně-ekonomických věd

• Knihovna AV ČR
• Národohospodářský ústav AV ČR
• Psychologický ústav AV ČR
• Sociologický ústav AV ČR
• Ústav státu a práva AV ČR

Sekce historických věd

• Archeologický ústav AV ČR, Brno
• Archeologický ústav AV ČR, Praha
• Historický ústav AV ČR
• Masarykův ústav a Archiv AV ČR
• Ústav dějin umění AV ČR
• Ústav pro soudobé dějiny AV ČR

Sekce humanitních a filologických věd

• Etnologický ústav AV ČR
• Filosofický ústav AV ČR
• Orientální ústav AV ČR
• Slovanský ústav AV ČR
• Ústav pro českou literaturu AV ČR
• Ústav pro jazyk český AV ČR

Ostatní

• Středisko společných činností AV ČR

Instituce Ministerstva dopravy ČR

• Centrum dopravního výzkumu

Instituce Ministerstva práce a sociálních věcí ČR

• Výzkumný ústav bezpečnosti práce
• Výzkumný ústav práce a sociálních věcí

Instituce Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy ČR

• Centrum pro studium vysokého školství

Instituce Ministerstva zahraničních věcí ČR

• Ústav mezinárodních vztahů

Instituce Ministerstva zemědělství ČR

• Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti
• Výzkumný ústav meliorací a ochrany půdy
• Výzkumný ústav potravinářský Praha
• Výzkumný ústav rostlinné výroby
• Výzkumný ústav veterinárního lékařství
• Výzkumný ústav zemědělské techniky
• Výzkumný ústav živočišné výroby

Instituce Ministerstva životního prostředí ČR

• Výzkumný ústav Silva Taroucy pro krajinu a okrasné zahradnictví
• Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka

Instituce Českého úřadu zeměměřického a katastrálního

• Výzkumný ústav geodetický, topografický a kartografický

Instituce Státního úřadu pro jadernou bezpečnost

• Státní ústav jaderné, chemické a biologické ochrany
• Státní ústav radiační ochrany

Instituce Jihomoravského kraje

• Ústav archeologické památkové péče Brno

Instituce Karlovarského kraje

• Institut lázeňství a balneologie

Instituce Královéhradeckého krajeeditovat | editovat zdroj

• Výzkumný institut ochrany genofondů

Instituce Ústeckého krajeeditovat | editovat zdroj

• Ústav archeologické památkové péče severozápadních Čech

Instituce Statutárního města Liberceeditovat | editovat zdroj

• Centrum pro výzkum energetického využití litosféry

Instituce Obce Mšené-lázněeditovat | editovat zdroj

• Výzkumný ústav balneologický

Externí odkazyeditovat | editovat zdroj

• Zákon č. 130/2002 Sb., o podpoře výzkumu a vývoje z veřejných prostředků a o změně některých souvisejících zákonů (zákon o podpoře výzkumu a vývoje), zakonyprolidi.cz
• Zákon č. 341/2005 Sb., o veřejných výzkumných institucích, zakonyprolidi.cz
• Rejstřík veřejných výzkumných institucí, rvvi.msmt.cz